Ο πόλεμος αποτελεί έναν από τους πιο κρίσιμους παράγοντες που επηρεάζουν τη λειτουργία των αεροπορικών εταιρειών παγκοσμίως. Σε αντίθεση με άλλες κρίσεις, όπως οι οικονομικές υφέσεις ή οι πανδημίες, οι πολεμικές συγκρούσεις έχουν άμεσες και πολυδιάστατες επιπτώσεις στη λειτουργία, το κόστος και τη στρατηγική των αερομεταφορέων. Η πολιτική αεροπορία βασίζεται στην ασφάλεια, την ελευθερία μετακίνησης και την προβλεψιμότητα, στοιχεία που δεν υφίστανται σε περιόδους πολέμου.

Ένας από τους βασικότερους παράγοντες είναι το κλείσιμο του εναέριου χώρου. Οι εμπόλεμες ζώνες και μεγάλες περιοχές γύρω από την εστία αυτή, καθίστανται μη προσβάσιμες, αναγκάζοντας τις αεροπορικές εταιρείες να τροποποιούν τα δρομολόγιά τους. Οι παρακάμψεις αυτές συνήθως αυξάνουν τη διάρκεια των πτήσεων, απαιτούν μεγαλύτερη κατανάλωση καυσίμων και ενδέχεται να χρειαστεί επιπλέον προσωπικό λόγω των περιορισμών στις ώρες εργασίας.

Σημαντική είναι επίσης και η αύξηση του λειτουργικού κόστους. Οι γεωπολιτικές εντάσεις προκαλούν αστάθεια στις αγορές, με αποτέλεσμα την άνοδο των τιμών των καυσίμων, που αποτελούν μεγάλο μέρος των συνολικών εξόδων μιας αεροπορικής εταιρείας. Οι αυξήσεις αυτές συχνά μετακυλίονται στους επιβάτες μέσω υψηλότερων τιμών εισιτηρίων ενώ ταυτόχρονα, αυξάνονται και τα ασφάλιστρα κινδύνου για πτήσεις κοντά σε περιοχές συγκρούσεων, καθιστώντας ορισμένα δρομολόγια οικονομικά μη βιώσιμα.

Η ζήτηση ταξιδιών επηρεάζεται επίσης σημαντικά. Οι επιβάτες τείνουν να αποφεύγουν ταξίδια όχι μόνο προς τις εμπόλεμες περιοχές αλλά και προς γειτονικές χώρες, λόγω φόβου και ανασφάλειας. Αυτό έχει άμεσο αντίκτυπο και στον τουρισμό και οδηγεί σε μείωση της πληρότητας των πτήσεων και των εσόδων αντίστοιχα. Ως αποτέλεσμα, οι αεροπορικές εταιρείες αναγκάζονται πολλές φορές να περιορίσουν ή και να καταργήσουν δρομολόγια ως εμπορικά ασύμφορα.

Ο πόλεμος λειτουργεί ως πολλαπλασιαστής κινδύνου για τις αεροπορικές εταιρείες. Ακόμη και όσες εταιρείες δεν δραστηριοποιούνται άμεσα σε εμπόλεμες περιοχές, επηρεάζονται από τις ευρύτερες οικονομικές και επιχειρησιακές αναταράξεις. Η επιβίωση μιας αεροπορικής εταιρείας σε ένα τέτοιο περιβάλλον εξαρτάται από την ευελιξία στον σχεδιασμό, την γρήγορη προσαρμογή των δρομολογίων και την οικονομική ανθεκτικότητα της. Για τον λόγο αυτό, πολλές αεροπορικές εταιρείες προχωρούν σε μείωση στόλου, αύξηση τιμών των εισιτηρίων, περιορισμό ή και προσωρινή αναστολή δρομολογίων έως ότου αποκατασταθεί η σταθερότητα.